Το Κύπελλο ΕΠΣ Ηρακλείου μπαίνει πλέον στη σημαντικότερη καμπή του, καθώς από την 3η φάση και μετά ο ανταγωνισμός αυξάνεται με την είσοδο όλων των ομάδων της Α1 ΕΠΣΗ - «GT KOSMOS» αλλά και εκείνων που προκρίθηκαν από τη β’ φάση. Συνολικά, 28 ομάδες θα βρεθούν στην κληρωτίδα, δίνοντας το έναυσμα για μια ιδιαίτερα απαιτητική συνέχεια.
Η 3η φάση αποτελεί το πρώτο μεγάλο «φιλτράρισμα» του θεσμού. Εκτός από τις ομάδες που πήραν την πρόκριση μέσα στο γήπεδο, συμμετέχουν και οι τέσσερις που είχαν περάσει άνευ αγώνος από τη 2η φάση. Ωστόσο, σε αυτή την κλήρωση υπάρχει ένας σημαντικός περιορισμός: οι ομάδες που είχαν προκριθεί χωρίς αγώνα στον προηγούμενο γύρο δεν έχουν δικαίωμα να ξαναβρεθούν σε θέση άνευ αγώνος. Αυτό σημαίνει ότι οι τέσσερις θέσεις πρόκρισης «στα χαρτιά» θα αφορούν αποκλειστικά τις υπόλοιπες ομάδες και όχι τα σωματεία του Αγίου Ιωάννη, της Τυλίσου, του Ζαρού και των Μοιρών, που είχαν ήδη προκριθεί μία φορά άνευ αγώνος.
Με αυτόν τον τρόπο, στη 3η φάση θα δημιουργηθούν 12 ζευγάρια, από τα οποία θα προκύψουν 12 νικήτριες ομάδες. Σε αυτές θα προστεθούν οι τέσσερις ομάδες που θα περάσουν χωρίς αγώνα, ώστε ο αριθμός να συμπληρωθεί στις 16 συνολικά για την επόμενη φάση.
Η 4η φάση θα έχει 16 σωματεία να σχηματίζουν οκτώ ζευγάρια. Οι νικητές θα προκριθούν στην 5η φάση, όπου τέσσερις ομάδες θα μείνουν στη μάχη του θεσμού. Οι δύο ημιτελικοί θα αναδείξουν τους φιναλίστ που θα φτάσουν στη 6η φάση, τον μεγάλο τελικό του Κυπέλλου ΕΠΣΗ.
Το φορμάτ εξασφαλίζει μεγάλο αριθμό νοκ άουτ αναμετρήσεων, υψηλό επίπεδο ανταγωνισμού και αρκετές πιθανότητες για εκπλήξεις, καθώς μικρότερα σωματεία έχουν την ευκαιρία να φτάσουν βαθιά στη διοργάνωση. Το επόμενο διάστημα αναμένεται με ενδιαφέρον από ομάδες και φιλάθλους, καθώς το Κύπελλο μπαίνει στα πιο συναρπαστικά του στάδια.
Σύμφωνα με την προκήρυξη, όλοι οι αγώνες είναι νοκ άουτ και σε περίπτωση ισοπαλίας ακολουθεί απευθείας η διαδικασία των πέναλτι. Όταν μια ομάδα προέρχεται από χαμηλότερη κατηγορία, τότε ο αγώνας διεξάγεται στην έδρα της, ενώ αν οι δύο αντίπαλοι είναι της ίδιας κατηγορίας, το γηπεδούχο σωματείο προκύπτει από την κλήρωση.
