Δικαίωμα συμμετοχής στα τοπικά πρωταθλήματα της ΕΠΣ Ηρακλείου έχουν και φέτος οι Β’ ομάδες των σωματείων, σύμφωνα με τον ισχύοντα κανονισμό.
Οι λεγόμενες «δεύτερες ομάδες» μπορούν να αγωνιστούν κανονικά στη χαμηλότερη κατηγορία και εφόσον πληρούν τις αγωνιστικές προϋποθέσεις, να διεκδικήσουν την άνοδό τους.
Ωστόσο, σύμφωνα με τον κανονισμό της ΕΠΟ, δεν επιτρέπεται η συμμετοχή της Β’ ομάδας στην ίδια κατηγορία με την «ανδρική» ομάδα.
Αναλυτικά η προκήρυξη της ΕΠΣΗ
«Δικαίωμα συμμετοχής στα τοπικά πρωταθλήματα της ΕΠΣΗ έχουν οι Β’ Ομάδες των Σωματείων. Μία Β’ Ομάδα θα μπορεί να προβιβαστεί στην επόμενη κατηγορία αλλά σε κάθε περίπτωση και σύμφωνα με τα όσα αναφέρει ο κανονισμός της ΕΠΟ, η Β’ ομάδα δεν θα μπορεί να συμμετάσχει στην ίδια κατηγορία με την κύρια ομάδα του Σωματείου».