Για τέταρτη διαδοχική χρονιά η ΕΠΣΗ θα διοργανώσει την ημιτελική φάση και τελική φάση του Κυπέλλου ΕΠΣΗ σε μορφή Final Four.
Μετά τη σπουδαία επιτυχία στις τρεις πρώτες διοργανώσεις σε Κρουσώνα, Τυμπάκι και Αρκαλοχώρι, η διοίκηση της ΕΠΣΗ αποφάσισε πως και για τέταρτη σερί σεζόν θα διοργανωθεί το Final Four, για να προκύψει ο Κυπελλούχος Ηρακλείου για τη σεζόν 2024/25. Μάλιστα στην προκήρυξη αναφέρεται πως η απόφαση σχετικά με τον τόπο διεξαγωγής θα παρθεί μέχρι τις 31 Ιανουαρίου 2025.
Αναφορικά τώρα με το σύστημα τέλεσης των αγώνων. δεν υπάρχει διαφοροποίηση, αφού στην 1η φάση συμμετέχουν οι ομάδες που έχουν δηλώσει συμμετοχή και αγωνίζονται στην Β’ ΕΠΣΗ, στη 2η φάση συμμετέχουν όσες προκρίθηκαν από την 1η φάση μαζί με τις ομάδες που αγωνίζονται στην Α2 ΕΠΣΗ, ενώ στην 3η φάση συμμετέχουν όσες προκρίθηκαν από την 2η φάση μαζί με τις ομάδες που αγωνίζονται στην Α1 ΕΠΣΗ και στην Γ’ Εθνική.
Στις επόμενες φάσεις ως και τον τελικό συμμετέχουν όσες ομάδες προκρίνονται μετά από νοκ άουτ αγώνες. Από την 2η έως και την προημιτελική φάση, η ομάδα χαμηλότερης κατηγορίας αγωνίζεται εντός έδρας.